Professeur des universités depuis 1979, il a été chef du service de gynécologieobstétrique et de médecine de la reproduction de 1990 à 2010 à l'hôpital Antoine Béclère, Clamart, et chef du pôle Femme couple embryon enfant (2006-2011).
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Il a été à l'initiative des traitements d'assistance médicale à la procréation en France. Au cours de sa carrière, il fut responsable d'équipes de recherche au sein de l'unité INSERM 782 (2006- 2010), directeur d'enseignement à la Faculté de médecine PARIS XI et responsable du projet médical de la maternité de l'hôpital Bicêtre. Il a aussi été membre du Comité national des droits de l'Homme (1987-1988) et du Comité national consultatif d'éthique pour les sciences de la vie et de la santé (1986-1990), chargé de mission bioéthique auprès du ministre de la santé (1992), il a participé au plan de périnatalité auprès du secrétaire d'Etat à la santé (1997-1998) et fut conseiller technique auprès du ministre de la recherche (2001-2002).

Actuellement président du Haut Comité médical de la région Ile-de-France, il a aussi été membre de la Commission nationale de la naissance (2005-2007) et du Conseil scientifique de la région Ile-de-France (2006-2010). René Frydman est membre de plusieurs sociétés savantes françaises et internationales, et Associated Editor du Journal Fertility and Sterility.